Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl6P47911 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl6P47911 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl6P47911 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl6P47911 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl6P47911 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl6P47911 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl6P47911 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl6P47911 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl6P47911 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl6P47911 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl6P47911 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl6P47911 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl6P47911 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl6P47911 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl6P47911 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpl6P47911 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl6P47911 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl6P47911 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpl6P47911 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl6P47911 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl6P47911 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpl6P47911 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl6P47911 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl6P47911 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl6P47911 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl6P47911 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms