Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Myo1bP46735 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Myo1bP46735 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Myo1bP46735 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Myo1bP46735 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Myo1bP46735 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Myo1bP46735 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Myo1bP46735 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Myo1bP46735 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Myo1bP46735 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Myo1bP46735 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Myo1bP46735 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Myo1bP46735 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Myo1bP46735 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Myo1bP46735 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Myo1bP46735 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Myo1bP46735 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Myo1bP46735 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Myo1bP46735 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Myo1bP46735 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Myo1bP46735 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Myo1bP46735 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Myo1bP46735 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Myo1bP46735 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Myo1bP46735 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Myo1bP46735 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30,43■■■□□ 2,46
Myo1bP46735 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Myo1bP46735 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
Myo1bP46735 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
Myo1bP46735 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Myo1bP46735 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Myo1bP46735 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Myo1bP46735 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Myo1bP46735 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Myo1bP46735 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Myo1bP46735 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Myo1bP46735 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Myo1bP46735 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Myo1bP46735 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Myo1bP46735 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Myo1bP46735 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Myo1bP46735 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Myo1bP46735 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Myo1bP46735 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Myo1bP46735 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Myo1bP46735 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Myo1bP46735 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Myo1bP46735 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Myo1bP46735 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Myo1bP46735 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Myo1bP46735 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Myo1bP46735 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Myo1bP46735 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Myo1bP46735 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Myo1bP46735 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Myo1bP46735 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
Myo1bP46735 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Myo1bP46735 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Myo1bP46735 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Myo1bP46735 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Myo1bP46735 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Myo1bP46735 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Myo1bP46735 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Myo1bP46735 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Myo1bP46735 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Myo1bP46735 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Myo1bP46735 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Myo1bP46735 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Myo1bP46735 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Myo1bP46735 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Myo1bP46735 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Myo1bP46735 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Myo1bP46735 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Myo1bP46735 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Myo1bP46735 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Myo1bP46735 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Myo1bP46735 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Myo1bP46735 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Myo1bP46735 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Myo1bP46735 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Myo1bP46735 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Myo1bP46735 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Myo1bP46735 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Myo1bP46735 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Myo1bP46735 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Myo1bP46735 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Myo1bP46735 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Myo1bP46735 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Myo1bP46735 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Myo1bP46735 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Myo1bP46735 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Myo1bP46735 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Myo1bP46735 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Myo1bP46735 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Myo1bP46735 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Myo1bP46735 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Myo1bP46735 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Myo1bP46735 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Myo1bP46735 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Myo1bP46735 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,2 ms