Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21,92■■□□□ 1,1
Rab11bP46638 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Rab11bP46638 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Rab11bP46638 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Rab11bP46638 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Rab11bP46638 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Rab11bP46638 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Rab11bP46638 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Rab11bP46638 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Rab11bP46638 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Rab11bP46638 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Rab11bP46638 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Rab11bP46638 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Rab11bP46638 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Rab11bP46638 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,78■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Rab11bP46638 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21,76■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,73■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Rab11bP46638 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Rab11bP46638 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,58■■□□□ 1,05
Rab11bP46638 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,54■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Rab11bP46638 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,52■■□□□ 1,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,7 ms