Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Syt1P46096 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Syt1P46096 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Syt1P46096 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Syt1P46096 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Syt1P46096 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Syt1P46096 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Syt1P46096 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Syt1P46096 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Syt1P46096 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Syt1P46096 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Syt1P46096 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Syt1P46096 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Syt1P46096 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,71■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Syt1P46096 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Syt1P46096 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Syt1P46096 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Syt1P46096 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Syt1P46096 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Syt1P46096 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Syt1P46096 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Syt1P46096 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Syt1P46096 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Syt1P46096 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Syt1P46096 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Syt1P46096 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Syt1P46096 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Syt1P46096 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Syt1P46096 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Syt1P46096 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Syt1P46096 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Syt1P46096 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Syt1P46096 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Syt1P46096 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Syt1P46096 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Syt1P46096 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Syt1P46096 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Syt1P46096 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Syt1P46096 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Syt1P46096 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Syt1P46096 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Syt1P46096 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Syt1P46096 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Syt1P46096 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Syt1P46096 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Syt1P46096 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Syt1P46096 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Syt1P46096 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Syt1P46096 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
Syt1P46096 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Syt1P46096 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Syt1P46096 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Syt1P46096 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Syt1P46096 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Syt1P46096 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Syt1P46096 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Syt1P46096 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Syt1P46096 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Syt1P46096 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Syt1P46096 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Syt1P46096 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Syt1P46096 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Syt1P46096 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Syt1P46096 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Syt1P46096 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Syt1P46096 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Syt1P46096 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Syt1P46096 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Syt1P46096 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Syt1P46096 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Syt1P46096 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Syt1P46096 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Syt1P46096 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Syt1P46096 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Syt1P46096 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Syt1P46096 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Syt1P46096 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,1 ms