Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgirP43252 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgirP43252 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgirP43252 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtgirP43252 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtgirP43252 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgirP43252 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtgirP43252 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtgirP43252 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgirP43252 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgirP43252 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgirP43252 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgirP43252 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtgirP43252 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgirP43252 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtgirP43252 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgirP43252 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgirP43252 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtgirP43252 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgirP43252 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtgirP43252 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtgirP43252 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgirP43252 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgirP43252 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtgirP43252 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtgirP43252 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtgirP43252 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtgirP43252 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtgirP43252 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgirP43252 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgirP43252 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgirP43252 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgirP43252 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgirP43252 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PtgirP43252 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtgirP43252 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PtgirP43252 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgirP43252 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgirP43252 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PtgirP43252 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgirP43252 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgirP43252 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgirP43252 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtgirP43252 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgirP43252 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgirP43252 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtgirP43252 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtgirP43252 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgirP43252 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgirP43252 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgirP43252 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtgirP43252 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtgirP43252 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtgirP43252 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtgirP43252 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtgirP43252 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtgirP43252 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtgirP43252 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtgirP43252 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtgirP43252 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtgirP43252 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtgirP43252 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtgirP43252 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtgirP43252 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtgirP43252 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtgirP43252 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms