Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NodalP43021 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NodalP43021 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NodalP43021 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NodalP43021 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NodalP43021 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NodalP43021 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NodalP43021 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NodalP43021 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NodalP43021 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NodalP43021 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NodalP43021 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NodalP43021 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NodalP43021 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NodalP43021 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NodalP43021 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NodalP43021 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NodalP43021 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NodalP43021 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NodalP43021 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NodalP43021 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NodalP43021 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NodalP43021 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NodalP43021 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NodalP43021 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NodalP43021 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NodalP43021 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NodalP43021 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NodalP43021 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NodalP43021 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NodalP43021 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NodalP43021 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NodalP43021 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NodalP43021 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NodalP43021 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NodalP43021 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NodalP43021 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NodalP43021 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NodalP43021 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NodalP43021 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NodalP43021 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NodalP43021 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NodalP43021 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NodalP43021 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NodalP43021 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NodalP43021 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NodalP43021 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NodalP43021 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NodalP43021 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NodalP43021 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NodalP43021 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NodalP43021 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NodalP43021 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NodalP43021 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NodalP43021 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NodalP43021 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NodalP43021 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NodalP43021 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NodalP43021 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NodalP43021 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NodalP43021 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NodalP43021 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NodalP43021 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NodalP43021 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NodalP43021 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NodalP43021 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NodalP43021 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NodalP43021 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NodalP43021 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NodalP43021 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NodalP43021 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NodalP43021 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NodalP43021 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NodalP43021 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NodalP43021 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NodalP43021 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NodalP43021 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NodalP43021 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NodalP43021 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NodalP43021 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NodalP43021 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NodalP43021 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NodalP43021 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NodalP43021 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NodalP43021 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NodalP43021 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NodalP43021 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NodalP43021 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NodalP43021 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NodalP43021 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NodalP43021 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NodalP43021 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NodalP43021 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NodalP43021 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NodalP43021 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NodalP43021 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NodalP43021 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NodalP43021 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NodalP43021 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NodalP43021 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms