Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pbx1P41778 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pbx1P41778 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pbx1P41778 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pbx1P41778 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pbx1P41778 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pbx1P41778 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pbx1P41778 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Pbx1P41778 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbx1P41778 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbx1P41778 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbx1P41778 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbx1P41778 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbx1P41778 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbx1P41778 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pbx1P41778 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbx1P41778 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbx1P41778 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbx1P41778 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pbx1P41778 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pbx1P41778 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pbx1P41778 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pbx1P41778 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pbx1P41778 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pbx1P41778 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pbx1P41778 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pbx1P41778 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pbx1P41778 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbx1P41778 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbx1P41778 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbx1P41778 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbx1P41778 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pbx1P41778 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pbx1P41778 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pbx1P41778 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pbx1P41778 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pbx1P41778 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pbx1P41778 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pbx1P41778 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pbx1P41778 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pbx1P41778 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pbx1P41778 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pbx1P41778 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pbx1P41778 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pbx1P41778 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pbx1P41778 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pbx1P41778 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pbx1P41778 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pbx1P41778 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pbx1P41778 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pbx1P41778 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pbx1P41778 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pbx1P41778 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pbx1P41778 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pbx1P41778 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pbx1P41778 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pbx1P41778 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pbx1P41778 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pbx1P41778 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pbx1P41778 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pbx1P41778 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pbx1P41778 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pbx1P41778 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pbx1P41778 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbx1P41778 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.6 ms