Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
CskP41241 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
CskP41241 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
CskP41241 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
CskP41241 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
CskP41241 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,95■■□□□ 1,74
CskP41241 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
CskP41241 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
CskP41241 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
CskP41241 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
CskP41241 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
CskP41241 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,9■■□□□ 1,74
CskP41241 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
CskP41241 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,74
CskP41241 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
CskP41241 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
CskP41241 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
CskP41241 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
CskP41241 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,86■■□□□ 1,73
CskP41241 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
CskP41241 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,85■■□□□ 1,73
CskP41241 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
CskP41241 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
CskP41241 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
CskP41241 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
CskP41241 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,81■■□□□ 1,72
CskP41241 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,81■■□□□ 1,72
CskP41241 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
CskP41241 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
CskP41241 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
CskP41241 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
CskP41241 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
CskP41241 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
CskP41241 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
CskP41241 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
CskP41241 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
CskP41241 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
CskP41241 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
CskP41241 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
CskP41241 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
CskP41241 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
CskP41241 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
CskP41241 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,72■■□□□ 1,71
CskP41241 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
CskP41241 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
CskP41241 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
CskP41241 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
CskP41241 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
CskP41241 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
CskP41241 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
CskP41241 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,66■■□□□ 1,7
CskP41241 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
CskP41241 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,66■■□□□ 1,7
CskP41241 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
CskP41241 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
CskP41241 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
CskP41241 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
CskP41241 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
CskP41241 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
CskP41241 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
CskP41241 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
CskP41241 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
CskP41241 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
CskP41241 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
CskP41241 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
CskP41241 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
CskP41241 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,58■■□□□ 1,69
CskP41241 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
CskP41241 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
CskP41241 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
CskP41241 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
CskP41241 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
CskP41241 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
CskP41241 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
CskP41241 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
CskP41241 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
CskP41241 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
CskP41241 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
CskP41241 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
CskP41241 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
CskP41241 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
CskP41241 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
CskP41241 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
CskP41241 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
CskP41241 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
CskP41241 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
CskP41241 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
CskP41241 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
CskP41241 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
CskP41241 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,47■■□□□ 1,67
CskP41241 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
CskP41241 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
CskP41241 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
CskP41241 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
CskP41241 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
CskP41241 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
CskP41241 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
CskP41241 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
CskP41241 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
CskP41241 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms