Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbP41155 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbP41155 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LtbP41155 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LtbP41155 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LtbP41155 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LtbP41155 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbP41155 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbP41155 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbP41155 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbP41155 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LtbP41155 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LtbP41155 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LtbP41155 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LtbP41155 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LtbP41155 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LtbP41155 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbP41155 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LtbP41155 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LtbP41155 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LtbP41155 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LtbP41155 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LtbP41155 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LtbP41155 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LtbP41155 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LtbP41155 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LtbP41155 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LtbP41155 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LtbP41155 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LtbP41155 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LtbP41155 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LtbP41155 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LtbP41155 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LtbP41155 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LtbP41155 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LtbP41155 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LtbP41155 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LtbP41155 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LtbP41155 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbP41155 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbP41155 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbP41155 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbP41155 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbP41155 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbP41155 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbP41155 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbP41155 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbP41155 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbP41155 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbP41155 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LtbP41155 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LtbP41155 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LtbP41155 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LtbP41155 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LtbP41155 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LtbP41155 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LtbP41155 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LtbP41155 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LtbP41155 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtbP41155 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LtbP41155 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtbP41155 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtbP41155 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtbP41155 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LtbP41155 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbP41155 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbP41155 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbP41155 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbP41155 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbP41155 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbP41155 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbP41155 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbP41155 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbP41155 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbP41155 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbP41155 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbP41155 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbP41155 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbP41155 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbP41155 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbP41155 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbP41155 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbP41155 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbP41155 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbP41155 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbP41155 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbP41155 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbP41155 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbP41155 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbP41155 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbP41155 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbP41155 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbP41155 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbP41155 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbP41155 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LtbP41155 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LtbP41155 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbP41155 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbP41155 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LtbP41155 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms