Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox7P40646 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox7P40646 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox7P40646 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox7P40646 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox7P40646 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox7P40646 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox7P40646 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox7P40646 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox7P40646 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox7P40646 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox7P40646 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox7P40646 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox7P40646 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox7P40646 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox7P40646 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox7P40646 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox7P40646 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox7P40646 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox7P40646 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox7P40646 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox7P40646 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox7P40646 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox7P40646 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox7P40646 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox7P40646 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox7P40646 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox7P40646 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox7P40646 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox7P40646 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox7P40646 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox7P40646 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox7P40646 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox7P40646 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox7P40646 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox7P40646 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox7P40646 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox7P40646 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox7P40646 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox7P40646 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox7P40646 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox7P40646 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox7P40646 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox7P40646 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox7P40646 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox7P40646 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox7P40646 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox7P40646 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox7P40646 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox7P40646 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox7P40646 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox7P40646 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms