Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csf3rP40223 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csf3rP40223 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Csf3rP40223 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Csf3rP40223 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csf3rP40223 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csf3rP40223 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csf3rP40223 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csf3rP40223 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csf3rP40223 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csf3rP40223 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csf3rP40223 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csf3rP40223 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csf3rP40223 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csf3rP40223 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csf3rP40223 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csf3rP40223 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csf3rP40223 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csf3rP40223 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Csf3rP40223 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csf3rP40223 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Csf3rP40223 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csf3rP40223 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csf3rP40223 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csf3rP40223 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csf3rP40223 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csf3rP40223 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csf3rP40223 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csf3rP40223 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csf3rP40223 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csf3rP40223 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csf3rP40223 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csf3rP40223 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csf3rP40223 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csf3rP40223 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csf3rP40223 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csf3rP40223 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Csf3rP40223 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csf3rP40223 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Csf3rP40223 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csf3rP40223 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csf3rP40223 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csf3rP40223 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csf3rP40223 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csf3rP40223 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csf3rP40223 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csf3rP40223 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csf3rP40223 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csf3rP40223 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csf3rP40223 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csf3rP40223 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csf3rP40223 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csf3rP40223 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csf3rP40223 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csf3rP40223 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csf3rP40223 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csf3rP40223 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csf3rP40223 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csf3rP40223 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms