Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ifnar1P33896 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ifnar1P33896 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ifnar1P33896 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ifnar1P33896 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ifnar1P33896 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ifnar1P33896 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ifnar1P33896 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ifnar1P33896 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ifnar1P33896 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ifnar1P33896 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ifnar1P33896 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ifnar1P33896 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ifnar1P33896 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ifnar1P33896 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ifnar1P33896 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ifnar1P33896 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ifnar1P33896 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ifnar1P33896 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ifnar1P33896 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ifnar1P33896 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ifnar1P33896 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ifnar1P33896 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ifnar1P33896 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ifnar1P33896 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ifnar1P33896 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ifnar1P33896 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ifnar1P33896 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ifnar1P33896 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ifnar1P33896 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ifnar1P33896 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ifnar1P33896 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ifnar1P33896 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ifnar1P33896 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ifnar1P33896 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ifnar1P33896 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ifnar1P33896 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ifnar1P33896 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ifnar1P33896 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ifnar1P33896 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ifnar1P33896 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ifnar1P33896 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ifnar1P33896 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ifnar1P33896 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ifnar1P33896 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ifnar1P33896 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ifnar1P33896 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ifnar1P33896 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ifnar1P33896 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ifnar1P33896 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ifnar1P33896 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ifnar1P33896 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ifnar1P33896 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ifnar1P33896 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ifnar1P33896 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ifnar1P33896 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ifnar1P33896 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ifnar1P33896 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ifnar1P33896 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ifnar1P33896 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ifnar1P33896 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ifnar1P33896 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ifnar1P33896 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ifnar1P33896 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ifnar1P33896 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ifnar1P33896 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms