Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc5P32043 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc5P32043 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc5P32043 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc5P32043 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc5P32043 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc5P32043 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc5P32043 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc5P32043 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc5P32043 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc5P32043 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc5P32043 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc5P32043 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc5P32043 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc5P32043 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc5P32043 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc5P32043 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc5P32043 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc5P32043 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc5P32043 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc5P32043 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc5P32043 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc5P32043 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc5P32043 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms