Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Cnga1P29974 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cnga1P29974 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Cnga1P29974 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Cnga1P29974 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Cnga1P29974 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Cnga1P29974 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Cnga1P29974 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Cnga1P29974 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Cnga1P29974 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Cnga1P29974 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35,11■■■■□ 3,21
Cnga1P29974 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Cnga1P29974 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Cnga1P29974 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Cnga1P29974 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Cnga1P29974 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Cnga1P29974 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Cnga1P29974 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Cnga1P29974 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Cnga1P29974 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Cnga1P29974 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Cnga1P29974 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Cnga1P29974 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Cnga1P29974 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34,99■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Cnga1P29974 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Cnga1P29974 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Cnga1P29974 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Cnga1P29974 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Cnga1P29974 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Cnga1P29974 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Cnga1P29974 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cnga1P29974 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cnga1P29974 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34,87■■■■□ 3,17
Cnga1P29974 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Cnga1P29974 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cnga1P29974 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cnga1P29974 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34,84■■■■□ 3,17
Cnga1P29974 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Cnga1P29974 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Cnga1P29974 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34,81■■■■□ 3,16
Cnga1P29974 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Cnga1P29974 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34,76■■■■□ 3,16
Cnga1P29974 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Cnga1P29974 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Cnga1P29974 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Cnga1P29974 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Cnga1P29974 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Cnga1P29974 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
Cnga1P29974 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Cnga1P29974 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Cnga1P29974 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Cnga1P29974 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,65■■■■□ 3,14
Cnga1P29974 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Cnga1P29974 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Cnga1P29974 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Cnga1P29974 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Cnga1P29974 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Cnga1P29974 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Cnga1P29974 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
Cnga1P29974 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Cnga1P29974 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Cnga1P29974 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Cnga1P29974 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Cnga1P29974 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Cnga1P29974 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Cnga1P29974 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34,51■■■■□ 3,12
Cnga1P29974 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Cnga1P29974 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Cnga1P29974 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Cnga1P29974 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Cnga1P29974 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Cnga1P29974 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Cnga1P29974 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Cnga1P29974 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Cnga1P29974 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Cnga1P29974 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Cnga1P29974 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34,41■■■■□ 3,1
Cnga1P29974 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Cnga1P29974 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34,4■■■■□ 3,1
Cnga1P29974 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Cnga1P29974 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Cnga1P29974 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Cnga1P29974 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Cnga1P29974 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Cnga1P29974 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Cnga1P29974 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Cnga1P29974 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Cnga1P29974 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms