Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TbpP29037 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TbpP29037 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbpP29037 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbpP29037 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbpP29037 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbpP29037 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbpP29037 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbpP29037 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbpP29037 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbpP29037 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbpP29037 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbpP29037 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbpP29037 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbpP29037 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbpP29037 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TbpP29037 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TbpP29037 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TbpP29037 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TbpP29037 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TbpP29037 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TbpP29037 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TbpP29037 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TbpP29037 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TbpP29037 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TbpP29037 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TbpP29037 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TbpP29037 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TbpP29037 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TbpP29037 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TbpP29037 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TbpP29037 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TbpP29037 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TbpP29037 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbpP29037 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbpP29037 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TbpP29037 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbpP29037 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbpP29037 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbpP29037 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbpP29037 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TbpP29037 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TbpP29037 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TbpP29037 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TbpP29037 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TbpP29037 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TbpP29037 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TbpP29037 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TbpP29037 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TbpP29037 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TbpP29037 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TbpP29037 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TbpP29037 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TbpP29037 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TbpP29037 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TbpP29037 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TbpP29037 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TbpP29037 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TbpP29037 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TbpP29037 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TbpP29037 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TbpP29037 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TbpP29037 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TbpP29037 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TbpP29037 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TbpP29037 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TbpP29037 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TbpP29037 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TbpP29037 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TbpP29037 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TbpP29037 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TbpP29037 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TbpP29037 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TbpP29037 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TbpP29037 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TbpP29037 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TbpP29037 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TbpP29037 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TbpP29037 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TbpP29037 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TbpP29037 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TbpP29037 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TbpP29037 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TbpP29037 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TbpP29037 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TbpP29037 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TbpP29037 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TbpP29037 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TbpP29037 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TbpP29037 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TbpP29037 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TbpP29037 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TbpP29037 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbpP29037 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbpP29037 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbpP29037 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbpP29037 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbpP29037 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TbpP29037 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TbpP29037 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms