Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PtprmP28828 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PtprmP28828 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PtprmP28828 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PtprmP28828 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
PtprmP28828 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PtprmP28828 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PtprmP28828 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PtprmP28828 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PtprmP28828 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PtprmP28828 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PtprmP28828 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PtprmP28828 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PtprmP28828 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PtprmP28828 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PtprmP28828 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PtprmP28828 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PtprmP28828 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PtprmP28828 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38■■■■□ 3.67
PtprmP28828 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PtprmP28828 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PtprmP28828 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PtprmP28828 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PtprmP28828 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PtprmP28828 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PtprmP28828 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PtprmP28828 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PtprmP28828 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
PtprmP28828 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PtprmP28828 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprmP28828 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprmP28828 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprmP28828 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprmP28828 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PtprmP28828 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PtprmP28828 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PtprmP28828 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PtprmP28828 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PtprmP28828 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PtprmP28828 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PtprmP28828 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PtprmP28828 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PtprmP28828 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PtprmP28828 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PtprmP28828 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
PtprmP28828 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PtprmP28828 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PtprmP28828 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PtprmP28828 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PtprmP28828 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PtprmP28828 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PtprmP28828 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PtprmP28828 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PtprmP28828 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
PtprmP28828 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PtprmP28828 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PtprmP28828 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PtprmP28828 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PtprmP28828 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PtprmP28828 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PtprmP28828 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PtprmP28828 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PtprmP28828 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PtprmP28828 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PtprmP28828 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PtprmP28828 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PtprmP28828 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PtprmP28828 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PtprmP28828 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PtprmP28828 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PtprmP28828 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PtprmP28828 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PtprmP28828 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PtprmP28828 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PtprmP28828 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PtprmP28828 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PtprmP28828 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PtprmP28828 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PtprmP28828 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PtprmP28828 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
PtprmP28828 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PtprmP28828 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PtprmP28828 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PtprmP28828 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PtprmP28828 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PtprmP28828 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PtprmP28828 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PtprmP28828 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PtprmP28828 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PtprmP28828 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PtprmP28828 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PtprmP28828 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PtprmP28828 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PtprmP28828 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PtprmP28828 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PtprmP28828 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PtprmP28828 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PtprmP28828 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PtprmP28828 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PtprmP28828 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms