Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
RxraP28700 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
RxraP28700 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
RxraP28700 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
RxraP28700 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
RxraP28700 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
RxraP28700 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
RxraP28700 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
RxraP28700 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
RxraP28700 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
RxraP28700 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
RxraP28700 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
RxraP28700 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
RxraP28700 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
RxraP28700 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
RxraP28700 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
RxraP28700 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
RxraP28700 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
RxraP28700 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
RxraP28700 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
RxraP28700 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
RxraP28700 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
RxraP28700 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,13■■□□□ 1,61
RxraP28700 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
RxraP28700 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
RxraP28700 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
RxraP28700 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
RxraP28700 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
RxraP28700 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
RxraP28700 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
RxraP28700 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
RxraP28700 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
RxraP28700 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,08■■□□□ 1,61
RxraP28700 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
RxraP28700 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
RxraP28700 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,07■■□□□ 1,6
RxraP28700 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
RxraP28700 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
RxraP28700 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
RxraP28700 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
RxraP28700 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
RxraP28700 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
RxraP28700 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
RxraP28700 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
RxraP28700 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
RxraP28700 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
RxraP28700 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
RxraP28700 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
RxraP28700 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
RxraP28700 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
RxraP28700 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
RxraP28700 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
RxraP28700 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
RxraP28700 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
RxraP28700 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
RxraP28700 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
RxraP28700 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
RxraP28700 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24,89■■□□□ 1,58
RxraP28700 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
RxraP28700 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
RxraP28700 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
RxraP28700 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24,86■■□□□ 1,57
RxraP28700 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
RxraP28700 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
RxraP28700 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
RxraP28700 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
RxraP28700 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
RxraP28700 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
RxraP28700 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
RxraP28700 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
RxraP28700 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
RxraP28700 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
RxraP28700 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
RxraP28700 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
RxraP28700 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,81■■□□□ 1,56
RxraP28700 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
RxraP28700 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,8■■□□□ 1,56
RxraP28700 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
RxraP28700 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
RxraP28700 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
RxraP28700 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
RxraP28700 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
RxraP28700 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
RxraP28700 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
RxraP28700 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
RxraP28700 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
RxraP28700 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
RxraP28700 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
RxraP28700 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
RxraP28700 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
RxraP28700 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
RxraP28700 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
RxraP28700 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
RxraP28700 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
RxraP28700 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24,72■■□□□ 1,55
RxraP28700 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
RxraP28700 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
RxraP28700 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
RxraP28700 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
RxraP28700 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms