Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.57e-17■■■■■ 49.3
U2AF2P26368 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.97e-17■■■■■ 49.3
U2AF2P26368 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.967e-17■■■■■ 49.3
U2AF2P26368 SMG7-208ENST00000493609 624 ntTSL 34.09□□□□□ -1.757e-17■■■■■ 49.3
U2AF2P26368 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 49.1
U2AF2P26368 EIF5-211ENST00000559532 678 ntTSL 427.15■■□□□ 1.943e-35■■■■■ 49
U2AF2P26368 EIF5-209ENST00000559130 583 ntTSL 324.3■■□□□ 1.483e-35■■■■■ 49
U2AF2P26368 EIF5-215ENST00000560763 723 ntTSL 221.25■□□□□ 0.993e-35■■■■■ 49
U2AF2P26368 EIF5-214ENST00000560338 580 ntTSL 318.6■□□□□ 0.573e-35■■■■■ 49
U2AF2P26368 EIF5-210ENST00000559249 704 ntTSL 218.42■□□□□ 0.543e-35■■■■■ 49
U2AF2P26368 EIF5-216ENST00000560877 521 ntTSL 415.3■□□□□ 0.043e-35■■■■■ 49
U2AF2P26368 EIF5-203ENST00000558265 872 ntTSL 515.25■□□□□ 0.031e-13■■■■■ 49
U2AF2P26368 EIF5-204ENST00000558316 719 ntTSL 314.17□□□□□ -0.141e-13■■■■■ 49
U2AF2P26368 EIF5-206ENST00000558551 744 ntTSL 26.3□□□□□ -1.43e-35■■■■■ 49
U2AF2P26368 EIF5-213ENST00000560200 776 ntTSL 53.35□□□□□ -1.871e-13■■■■■ 49
U2AF2P26368 EIF5-218ENST00000561325 569 ntTSL 43.31□□□□□ -1.883e-35■■■■■ 49
U2AF2P26368 AC092953.1-201ENST00000460975 543 ntBASIC10.87□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 49
U2AF2P26368 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.72e-11■■■■■ 49
U2AF2P26368 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.782e-11■■■■■ 49
U2AF2P26368 DCUN1D1-206ENST00000492563 659 ntTSL 53.84□□□□□ -1.792e-11■■■■■ 49
U2AF2P26368 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.82e-11■■■■■ 49
U2AF2P26368 ARID1A-208ENST00000532781 2583 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.181e-21■■■■■ 48.9
U2AF2P26368 ARID1A-206ENST00000466382 2699 ntTSL 214.33□□□□□ -0.121e-21■■■■■ 48.9
U2AF2P26368 ARID1A-217ENST00000637788 3046 nt12.61□□□□□ -0.391e-21■■■■■ 48.9
U2AF2P26368 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 24e-28■■■■■ 48.7
U2AF2P26368 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.164e-28■■■■■ 48.7
U2AF2P26368 FAM118A-207ENST00000459849 695 ntTSL 315.62■□□□□ 0.094e-28■■■■■ 48.7
U2AF2P26368 FAM118A-209ENST00000476478 354 ntTSL 312.88□□□□□ -0.354e-28■■■■■ 48.7
U2AF2P26368 FAM118A-210ENST00000476754 675 ntTSL 312.61□□□□□ -0.394e-28■■■■■ 48.7
U2AF2P26368 FAM118A-215ENST00000487732 677 ntTSL 310.15□□□□□ -0.784e-28■■■■■ 48.7
U2AF2P26368 FGL1-207ENST00000518769 318 ntTSL 34.72□□□□□ -1.659e-11■■■■■ 48.6
U2AF2P26368 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.738e-17■■■■■ 48.5
U2AF2P26368 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.918e-17■■■■■ 48.5
U2AF2P26368 SUPT6H-211ENST00000584312 483 ntTSL 25.68□□□□□ -1.58e-17■■■■■ 48.5
U2AF2P26368 SUPT6H-203ENST00000577713 505 ntTSL 54.92□□□□□ -1.628e-17■■■■■ 48.5
U2AF2P26368 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.963e-16■■■■■ 48.3
U2AF2P26368 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.513e-16■■■■■ 48.3
U2AF2P26368 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.313e-16■■■■■ 48.3
U2AF2P26368 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.213e-16■■■■■ 48.3
U2AF2P26368 NCOA6-209ENST00000628752 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.36□□□□□ -1.393e-16■■■■■ 48.3
U2AF2P26368 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.219e-20■■■■■ 48.2
U2AF2P26368 MLX-209ENST00000591024 796 ntTSL 321■□□□□ 0.959e-20■■■■■ 48.2
U2AF2P26368 MLX-206ENST00000588320 2313 ntTSL 517.39■□□□□ 0.379e-20■■■■■ 48.2
U2AF2P26368 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.289e-20■■■■■ 48.2
U2AF2P26368 MLX-207ENST00000590050 2537 ntTSL 215.48■□□□□ 0.079e-20■■■■■ 48.2
U2AF2P26368 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.079e-20■■■■■ 48.2
U2AF2P26368 MLX-205ENST00000586393 851 ntTSL 513.92□□□□□ -0.189e-20■■■■■ 48.2
U2AF2P26368 MLX-204ENST00000585403 1068 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.59e-20■■■■■ 48.2
U2AF2P26368 PNISR-208ENST00000481229 395 ntTSL 31.75□□□□□ -2.138e-13■■■■■ 48.2
U2AF2P26368 WARS-207ENST00000553524 707 ntTSL 322.73■■□□□ 1.234e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-218ENST00000554772 562 ntTSL 321.2■□□□□ 0.984e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-209ENST00000553581 572 ntTSL 420.61■□□□□ 0.894e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-212ENST00000553934 530 ntTSL 319.72■□□□□ 0.754e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-239ENST00000557239 471 ntTSL 419.23■□□□□ 0.674e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-236ENST00000556783 567 ntTSL 519.08■□□□□ 0.644e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-214ENST00000554331 831 ntTSL 219.08■□□□□ 0.644e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-206ENST00000553413 568 ntTSL 518.45■□□□□ 0.544e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-222ENST00000555063 573 ntTSL 216.84■□□□□ 0.294e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.064e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 AOC2-201ENST00000253799 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.024e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-231ENST00000556579 565 ntTSL 214.66□□□□□ -0.064e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-215ENST00000554509 563 ntTSL 414.66□□□□□ -0.064e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-217ENST00000554605 560 ntTSL 314.31□□□□□ -0.124e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-210ENST00000553769 560 ntTSL 414.31□□□□□ -0.124e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-208ENST00000553545 591 ntTSL 412.21□□□□□ -0.454e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-233ENST00000556660 584 ntTSL 411.71□□□□□ -0.534e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-241ENST00000557347 577 ntTSL 411.71□□□□□ -0.534e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-228ENST00000556338 547 ntTSL 411.71□□□□□ -0.534e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-235ENST00000556698 640 ntTSL 411.71□□□□□ -0.534e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-211ENST00000553808 1060 ntTSL 210.08□□□□□ -0.84e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 RNF213-203ENST00000427003 3552 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.874e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-219ENST00000554820 538 ntTSL 47.85□□□□□ -1.154e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-237ENST00000557094 582 ntTSL 27.39□□□□□ -1.234e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-227ENST00000556295 517 ntTSL 36.9□□□□□ -1.34e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-225ENST00000555813 410 ntTSL 45.88□□□□□ -1.474e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-223ENST00000555410 677 ntTSL 55.8□□□□□ -1.484e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-234ENST00000556695 553 ntTSL 44.72□□□□□ -1.654e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-226ENST00000556209 564 ntTSL 44.66□□□□□ -1.664e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 WARS-221ENST00000555031 658 ntTSL 24.6□□□□□ -1.674e-11■■■■■ 48
U2AF2P26368 NFATC3-206ENST00000539828 2484 ntTSL 219.69■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-204ENST00000379165 3583 ntTSL 212.31□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-213ENST00000563319 4122 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-208ENST00000553077 3870 ntTSL 210.41□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-220ENST00000569766 3555 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-207ENST00000549350 3588 ntTSL 28.38□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-211ENST00000562926 3748 ntTSL 1 (best)7.88□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-216ENST00000566301 3840 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.184e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-212ENST00000563288 3790 ntTSL 1 (best)7.57□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-218ENST00000567152 3186 ntTSL 1 (best)6.93□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-221ENST00000570212 3181 ntTSL 1 (best)6.83□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-205ENST00000535127 4194 ntTSL 1 (best)6.5□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NFATC3-214ENST00000563796 3753 ntTSL 1 (best)5.07□□□□□ -1.64e-7■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 NCOA2-203ENST00000518363 1834 ntTSL 28.66□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 47.9
U2AF2P26368 MSH5-215ENST00000482280 944 ntTSL 222.09■■□□□ 1.132e-11■■■■■ 47.8
U2AF2P26368 MSH5-207ENST00000425703 694 ntTSL 520.71■□□□□ 0.912e-11■■■■■ 47.8
U2AF2P26368 AKAP9-209ENST00000484815 671 ntTSL 22.55□□□□□ -21e-8■■■■■ 47.6
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