Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gabra2P26048 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra2P26048 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra2P26048 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabra2P26048 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabra2P26048 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gabra2P26048 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gabra2P26048 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabra2P26048 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabra2P26048 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabra2P26048 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabra2P26048 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gabra2P26048 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabra2P26048 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gabra2P26048 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabra2P26048 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabra2P26048 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra2P26048 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabra2P26048 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabra2P26048 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabra2P26048 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabra2P26048 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabra2P26048 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabra2P26048 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabra2P26048 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra2P26048 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabra2P26048 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra2P26048 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra2P26048 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabra2P26048 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra2P26048 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra2P26048 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra2P26048 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra2P26048 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra2P26048 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabra2P26048 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra2P26048 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra2P26048 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra2P26048 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra2P26048 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabra2P26048 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabra2P26048 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabra2P26048 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabra2P26048 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra2P26048 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra2P26048 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabra2P26048 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabra2P26048 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabra2P26048 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra2P26048 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms