Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd1P25322 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnd1P25322 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnd1P25322 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccnd1P25322 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnd1P25322 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnd1P25322 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnd1P25322 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnd1P25322 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnd1P25322 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnd1P25322 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnd1P25322 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnd1P25322 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnd1P25322 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnd1P25322 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccnd1P25322 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccnd1P25322 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccnd1P25322 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccnd1P25322 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnd1P25322 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccnd1P25322 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnd1P25322 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnd1P25322 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnd1P25322 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnd1P25322 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnd1P25322 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnd1P25322 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnd1P25322 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnd1P25322 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnd1P25322 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnd1P25322 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnd1P25322 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd1P25322 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccnd1P25322 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnd1P25322 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnd1P25322 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnd1P25322 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnd1P25322 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnd1P25322 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnd1P25322 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnd1P25322 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms