Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pax3P24610 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pax3P24610 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pax3P24610 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pax3P24610 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Pax3P24610 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pax3P24610 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pax3P24610 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pax3P24610 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pax3P24610 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pax3P24610 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pax3P24610 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pax3P24610 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pax3P24610 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pax3P24610 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pax3P24610 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pax3P24610 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pax3P24610 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pax3P24610 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pax3P24610 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pax3P24610 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pax3P24610 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pax3P24610 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pax3P24610 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pax3P24610 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pax3P24610 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pax3P24610 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pax3P24610 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pax3P24610 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pax3P24610 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pax3P24610 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pax3P24610 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pax3P24610 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pax3P24610 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pax3P24610 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pax3P24610 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pax3P24610 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pax3P24610 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pax3P24610 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pax3P24610 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pax3P24610 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pax3P24610 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pax3P24610 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pax3P24610 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pax3P24610 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pax3P24610 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pax3P24610 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pax3P24610 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Pax3P24610 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pax3P24610 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pax3P24610 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pax3P24610 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pax3P24610 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pax3P24610 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pax3P24610 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pax3P24610 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pax3P24610 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pax3P24610 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pax3P24610 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pax3P24610 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pax3P24610 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pax3P24610 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pax3P24610 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pax3P24610 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pax3P24610 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pax3P24610 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pax3P24610 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pax3P24610 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pax3P24610 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pax3P24610 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pax3P24610 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pax3P24610 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pax3P24610 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pax3P24610 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pax3P24610 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pax3P24610 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms