Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrkchP23298 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrkchP23298 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrkchP23298 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrkchP23298 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrkchP23298 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrkchP23298 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrkchP23298 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrkchP23298 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrkchP23298 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrkchP23298 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrkchP23298 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrkchP23298 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrkchP23298 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PrkchP23298 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrkchP23298 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrkchP23298 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PrkchP23298 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PrkchP23298 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PrkchP23298 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrkchP23298 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrkchP23298 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrkchP23298 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrkchP23298 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PrkchP23298 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrkchP23298 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PrkchP23298 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrkchP23298 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrkchP23298 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkchP23298 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkchP23298 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkchP23298 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkchP23298 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrkchP23298 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrkchP23298 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrkchP23298 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrkchP23298 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrkchP23298 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PrkchP23298 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PrkchP23298 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PrkchP23298 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrkchP23298 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrkchP23298 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PrkchP23298 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrkchP23298 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrkchP23298 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PrkchP23298 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrkchP23298 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrkchP23298 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrkchP23298 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrkchP23298 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrkchP23298 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrkchP23298 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrkchP23298 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrkchP23298 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrkchP23298 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrkchP23298 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrkchP23298 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrkchP23298 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrkchP23298 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrkchP23298 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrkchP23298 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrkchP23298 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrkchP23298 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkchP23298 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkchP23298 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrkchP23298 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PrkchP23298 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrkchP23298 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrkchP23298 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrkchP23298 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrkchP23298 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrkchP23298 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrkchP23298 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrkchP23298 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrkchP23298 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrkchP23298 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrkchP23298 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrkchP23298 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrkchP23298 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrkchP23298 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrkchP23298 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PrkchP23298 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrkchP23298 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrkchP23298 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrkchP23298 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkchP23298 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms