Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Myo5bP21271 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Myo5bP21271 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Myo5bP21271 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Myo5bP21271 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Myo5bP21271 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Myo5bP21271 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Myo5bP21271 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Myo5bP21271 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Myo5bP21271 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Myo5bP21271 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Myo5bP21271 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Myo5bP21271 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Myo5bP21271 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Myo5bP21271 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Myo5bP21271 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Myo5bP21271 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Myo5bP21271 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Myo5bP21271 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Myo5bP21271 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Myo5bP21271 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Myo5bP21271 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Myo5bP21271 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Myo5bP21271 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Myo5bP21271 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Myo5bP21271 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Myo5bP21271 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Myo5bP21271 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Myo5bP21271 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Myo5bP21271 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Myo5bP21271 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Myo5bP21271 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Myo5bP21271 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Myo5bP21271 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Myo5bP21271 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Myo5bP21271 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Myo5bP21271 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Myo5bP21271 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Myo5bP21271 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Myo5bP21271 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Myo5bP21271 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Myo5bP21271 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Myo5bP21271 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Myo5bP21271 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Myo5bP21271 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Myo5bP21271 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Myo5bP21271 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Myo5bP21271 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Myo5bP21271 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Myo5bP21271 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Myo5bP21271 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Myo5bP21271 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Myo5bP21271 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myo5bP21271 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Myo5bP21271 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Myo5bP21271 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Myo5bP21271 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Myo5bP21271 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Myo5bP21271 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Myo5bP21271 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Myo5bP21271 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Myo5bP21271 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Myo5bP21271 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Myo5bP21271 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Myo5bP21271 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Myo5bP21271 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Myo5bP21271 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Myo5bP21271 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Myo5bP21271 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Myo5bP21271 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Myo5bP21271 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Myo5bP21271 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Myo5bP21271 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Myo5bP21271 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Myo5bP21271 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Myo5bP21271 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Myo5bP21271 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Myo5bP21271 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Myo5bP21271 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Myo5bP21271 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Myo5bP21271 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Myo5bP21271 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Myo5bP21271 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Myo5bP21271 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Myo5bP21271 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Myo5bP21271 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Myo5bP21271 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Myo5bP21271 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Myo5bP21271 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms