Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Klra1P20937 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Klra1P20937 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Klra1P20937 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Klra1P20937 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Klra1P20937 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Klra1P20937 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Klra1P20937 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Klra1P20937 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Klra1P20937 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Klra1P20937 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Klra1P20937 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Klra1P20937 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Klra1P20937 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Klra1P20937 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Klra1P20937 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Klra1P20937 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Klra1P20937 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Klra1P20937 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Klra1P20937 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Klra1P20937 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Klra1P20937 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Klra1P20937 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Klra1P20937 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Klra1P20937 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Klra1P20937 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Klra1P20937 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Klra1P20937 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Klra1P20937 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Klra1P20937 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Klra1P20937 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Klra1P20937 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Klra1P20937 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Klra1P20937 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Klra1P20937 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Klra1P20937 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Klra1P20937 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Klra1P20937 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Klra1P20937 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Klra1P20937 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Klra1P20937 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Klra1P20937 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Klra1P20937 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Klra1P20937 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Klra1P20937 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26,47■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Klra1P20937 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Klra1P20937 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Klra1P20937 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Klra1P20937 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Klra1P20937 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Klra1P20937 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Klra1P20937 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Klra1P20937 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Klra1P20937 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Klra1P20937 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Klra1P20937 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Klra1P20937 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Klra1P20937 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Klra1P20937 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Klra1P20937 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,6 ms