Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Esr1P19785 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Esr1P19785 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esr1P19785 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Esr1P19785 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Esr1P19785 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esr1P19785 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Esr1P19785 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Esr1P19785 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Esr1P19785 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Esr1P19785 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Esr1P19785 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Esr1P19785 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Esr1P19785 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Esr1P19785 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Esr1P19785 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Esr1P19785 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esr1P19785 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esr1P19785 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esr1P19785 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esr1P19785 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esr1P19785 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Esr1P19785 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Esr1P19785 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Esr1P19785 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esr1P19785 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esr1P19785 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esr1P19785 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esr1P19785 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esr1P19785 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esr1P19785 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esr1P19785 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esr1P19785 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esr1P19785 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Esr1P19785 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Esr1P19785 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Esr1P19785 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Esr1P19785 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Esr1P19785 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Esr1P19785 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Esr1P19785 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Esr1P19785 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Esr1P19785 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Esr1P19785 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Esr1P19785 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Esr1P19785 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Esr1P19785 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Esr1P19785 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Esr1P19785 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Esr1P19785 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Esr1P19785 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Esr1P19785 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Esr1P19785 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Esr1P19785 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Esr1P19785 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Esr1P19785 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Esr1P19785 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Esr1P19785 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Esr1P19785 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Esr1P19785 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms