Protein–RNA interactions for Protein: P19221

F2, Prothrombin, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P19221 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F2P19221 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F2P19221 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
F2P19221 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
F2P19221 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
F2P19221 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
F2P19221 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
F2P19221 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
F2P19221 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F2P19221 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F2P19221 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F2P19221 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
F2P19221 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F2P19221 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F2P19221 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F2P19221 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F2P19221 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F2P19221 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F2P19221 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F2P19221 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F2P19221 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F2P19221 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F2P19221 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F2P19221 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F2P19221 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F2P19221 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F2P19221 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F2P19221 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F2P19221 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
F2P19221 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
F2P19221 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F2P19221 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F2P19221 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F2P19221 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P19221 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P19221 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P19221 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P19221 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P19221 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
F2P19221 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F2P19221 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P19221 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P19221 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P19221 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F2P19221 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F2P19221 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F2P19221 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P19221 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P19221 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P19221 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P19221 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P19221 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P19221 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P19221 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P19221 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F2P19221 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F2P19221 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F2P19221 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F2P19221 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F2P19221 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
F2P19221 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F2P19221 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F2P19221 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F2P19221 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F2P19221 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F2P19221 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F2P19221 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
F2P19221 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F2P19221 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F2P19221 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F2P19221 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
F2P19221 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F2P19221 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F2P19221 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F2P19221 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F2P19221 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F2P19221 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F2P19221 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F2P19221 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F2P19221 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F2P19221 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F2P19221 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F2P19221 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F2P19221 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F2P19221 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F2P19221 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F2P19221 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F2P19221 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F2P19221 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
F2P19221 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F2P19221 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F2P19221 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
F2P19221 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F2P19221 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F2P19221 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F2P19221 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F2P19221 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F2P19221 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F2P19221 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F2P19221 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms