Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P18530 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P18530 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P18530 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P18530 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P18530 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P18530 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P18530 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P18530 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
P18530 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P18530 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P18530 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P18530 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P18530 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P18530 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P18530 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P18530 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P18530 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P18530 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P18530 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
P18530 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
P18530 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P18530 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P18530 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P18530 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P18530 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P18530 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
P18530 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
P18530 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P18530 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
P18530 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P18530 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P18530 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18530 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18530 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18530 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18530 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18530 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18530 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
P18530 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18530 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18530 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18530 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18530 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
P18530 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18530 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18530 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18530 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18530 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18530 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18530 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18530 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18530 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18530 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18530 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18530 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18530 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18530 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18530 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18530 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18530 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18530 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18530 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18530 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18530 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18530 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18530 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18530 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18530 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18530 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18530 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18530 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18530 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18530 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P18530 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18530 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18530 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18530 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18530 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18530 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18530 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18530 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18530 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P18530 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18530 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18530 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18530 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18530 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18530 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18530 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18530 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18530 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18530 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18530 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18530 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18530 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18530 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18530 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P18530 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P18530 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms