Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra6P16305 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra6P16305 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra6P16305 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra6P16305 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra6P16305 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabra6P16305 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabra6P16305 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra6P16305 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabra6P16305 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra6P16305 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra6P16305 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra6P16305 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabra6P16305 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabra6P16305 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabra6P16305 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra6P16305 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra6P16305 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra6P16305 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra6P16305 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra6P16305 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra6P16305 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra6P16305 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra6P16305 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra6P16305 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra6P16305 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra6P16305 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra6P16305 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabra6P16305 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabra6P16305 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabra6P16305 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabra6P16305 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabra6P16305 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabra6P16305 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabra6P16305 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabra6P16305 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra6P16305 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra6P16305 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra6P16305 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabra6P16305 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabra6P16305 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabra6P16305 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabra6P16305 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabra6P16305 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabra6P16305 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gabra6P16305 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabra6P16305 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabra6P16305 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabra6P16305 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabra6P16305 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabra6P16305 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra6P16305 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms