Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnc1P15388 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnc1P15388 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnc1P15388 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnc1P15388 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnc1P15388 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnc1P15388 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnc1P15388 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnc1P15388 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnc1P15388 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnc1P15388 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnc1P15388 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnc1P15388 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnc1P15388 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnc1P15388 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnc1P15388 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnc1P15388 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcnc1P15388 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnc1P15388 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnc1P15388 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnc1P15388 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnc1P15388 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnc1P15388 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnc1P15388 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnc1P15388 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnc1P15388 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnc1P15388 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnc1P15388 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnc1P15388 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnc1P15388 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnc1P15388 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnc1P15388 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnc1P15388 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnc1P15388 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnc1P15388 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnc1P15388 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnc1P15388 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnc1P15388 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnc1P15388 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnc1P15388 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnc1P15388 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnc1P15388 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnc1P15388 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnc1P15388 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnc1P15388 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnc1P15388 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnc1P15388 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnc1P15388 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms