Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SrgnP13609 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SrgnP13609 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SrgnP13609 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SrgnP13609 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SrgnP13609 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SrgnP13609 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SrgnP13609 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SrgnP13609 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SrgnP13609 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SrgnP13609 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SrgnP13609 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SrgnP13609 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SrgnP13609 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SrgnP13609 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SrgnP13609 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SrgnP13609 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SrgnP13609 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SrgnP13609 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SrgnP13609 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SrgnP13609 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SrgnP13609 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SrgnP13609 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SrgnP13609 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SrgnP13609 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SrgnP13609 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SrgnP13609 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SrgnP13609 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SrgnP13609 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SrgnP13609 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SrgnP13609 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SrgnP13609 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SrgnP13609 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SrgnP13609 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SrgnP13609 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SrgnP13609 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SrgnP13609 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SrgnP13609 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SrgnP13609 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SrgnP13609 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SrgnP13609 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SrgnP13609 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SrgnP13609 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SrgnP13609 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SrgnP13609 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SrgnP13609 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SrgnP13609 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SrgnP13609 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SrgnP13609 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SrgnP13609 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SrgnP13609 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SrgnP13609 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SrgnP13609 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SrgnP13609 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SrgnP13609 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SrgnP13609 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SrgnP13609 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SrgnP13609 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SrgnP13609 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SrgnP13609 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SrgnP13609 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SrgnP13609 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SrgnP13609 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SrgnP13609 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SrgnP13609 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SrgnP13609 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SrgnP13609 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SrgnP13609 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SrgnP13609 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SrgnP13609 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SrgnP13609 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SrgnP13609 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SrgnP13609 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SrgnP13609 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SrgnP13609 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SrgnP13609 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.3 ms