Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vpreb1P13372 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vpreb1P13372 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vpreb1P13372 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vpreb1P13372 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms