Protein–RNA interactions for Protein: P11214

Plat, Tissue-type plasminogen activator, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlatP11214 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PlatP11214 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PlatP11214 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PlatP11214 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PlatP11214 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PlatP11214 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PlatP11214 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PlatP11214 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PlatP11214 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PlatP11214 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PlatP11214 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PlatP11214 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PlatP11214 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PlatP11214 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PlatP11214 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PlatP11214 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PlatP11214 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PlatP11214 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PlatP11214 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PlatP11214 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PlatP11214 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PlatP11214 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PlatP11214 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PlatP11214 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PlatP11214 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PlatP11214 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PlatP11214 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PlatP11214 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PlatP11214 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PlatP11214 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PlatP11214 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PlatP11214 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PlatP11214 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PlatP11214 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PlatP11214 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PlatP11214 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PlatP11214 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PlatP11214 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PlatP11214 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PlatP11214 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PlatP11214 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PlatP11214 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PlatP11214 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PlatP11214 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PlatP11214 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PlatP11214 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PlatP11214 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PlatP11214 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PlatP11214 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PlatP11214 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PlatP11214 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PlatP11214 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PlatP11214 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PlatP11214 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PlatP11214 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PlatP11214 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PlatP11214 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PlatP11214 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PlatP11214 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PlatP11214 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PlatP11214 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PlatP11214 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PlatP11214 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PlatP11214 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PlatP11214 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PlatP11214 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PlatP11214 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PlatP11214 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PlatP11214 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PlatP11214 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PlatP11214 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PlatP11214 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PlatP11214 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PlatP11214 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PlatP11214 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PlatP11214 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PlatP11214 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PlatP11214 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PlatP11214 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PlatP11214 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PlatP11214 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PlatP11214 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PlatP11214 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PlatP11214 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PlatP11214 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PlatP11214 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PlatP11214 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PlatP11214 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PlatP11214 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PlatP11214 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PlatP11214 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PlatP11214 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PlatP11214 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PlatP11214 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PlatP11214 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PlatP11214 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PlatP11214 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PlatP11214 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PlatP11214 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PlatP11214 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms