Protein–RNA interactions for Protein: P09803

Cdh1, Cadherin-1, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh1P09803 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdh1P09803 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdh1P09803 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdh1P09803 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdh1P09803 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdh1P09803 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh1P09803 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh1P09803 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdh1P09803 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdh1P09803 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdh1P09803 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdh1P09803 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdh1P09803 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdh1P09803 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdh1P09803 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdh1P09803 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh1P09803 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh1P09803 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh1P09803 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh1P09803 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh1P09803 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdh1P09803 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdh1P09803 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdh1P09803 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdh1P09803 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdh1P09803 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh1P09803 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdh1P09803 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms