Protein–RNA interactions for Protein: P09581

Csf1r, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1rP09581 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Csf1rP09581 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Csf1rP09581 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Csf1rP09581 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Csf1rP09581 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Csf1rP09581 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Csf1rP09581 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Csf1rP09581 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Csf1rP09581 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Csf1rP09581 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Csf1rP09581 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31,37■■■□□ 2,61
Csf1rP09581 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Csf1rP09581 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Csf1rP09581 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Csf1rP09581 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
Csf1rP09581 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Csf1rP09581 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Csf1rP09581 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Csf1rP09581 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Csf1rP09581 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Csf1rP09581 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Csf1rP09581 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Csf1rP09581 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Csf1rP09581 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Csf1rP09581 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Csf1rP09581 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Csf1rP09581 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Csf1rP09581 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Csf1rP09581 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Csf1rP09581 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Csf1rP09581 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Csf1rP09581 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Csf1rP09581 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Csf1rP09581 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Csf1rP09581 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Csf1rP09581 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Csf1rP09581 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Csf1rP09581 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31,02■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Csf1rP09581 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Csf1rP09581 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Csf1rP09581 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Csf1rP09581 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Csf1rP09581 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Csf1rP09581 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Csf1rP09581 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Csf1rP09581 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Csf1rP09581 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Csf1rP09581 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Csf1rP09581 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Csf1rP09581 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Csf1rP09581 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Csf1rP09581 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Csf1rP09581 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Csf1rP09581 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Csf1rP09581 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Csf1rP09581 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Csf1rP09581 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Csf1rP09581 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Csf1rP09581 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Csf1rP09581 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Csf1rP09581 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Csf1rP09581 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Csf1rP09581 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Csf1rP09581 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Csf1rP09581 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Csf1rP09581 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Csf1rP09581 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Csf1rP09581 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Csf1rP09581 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Csf1rP09581 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Csf1rP09581 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Csf1rP09581 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30,74■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Csf1rP09581 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms