Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-T23P06339 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-T23P06339 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-T23P06339 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-T23P06339 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-T23P06339 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2-T23P06339 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-T23P06339 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-T23P06339 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-T23P06339 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-T23P06339 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-T23P06339 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-T23P06339 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-T23P06339 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-T23P06339 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-T23P06339 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-T23P06339 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2-T23P06339 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2-T23P06339 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-T23P06339 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-T23P06339 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-T23P06339 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2-T23P06339 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-T23P06339 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-T23P06339 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-T23P06339 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-T23P06339 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-T23P06339 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-T23P06339 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-T23P06339 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-T23P06339 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-T23P06339 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-T23P06339 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-T23P06339 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-T23P06339 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-T23P06339 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-T23P06339 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2-T23P06339 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-T23P06339 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2-T23P06339 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2-T23P06339 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-T23P06339 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-T23P06339 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-T23P06339 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2-T23P06339 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
H2-T23P06339 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-T23P06339 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-T23P06339 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-T23P06339 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-T23P06339 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-T23P06339 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-T23P06339 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-T23P06339 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms