Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01852 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01852 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01852 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01852 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01852 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01852 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01852 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01852 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01852 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01852 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01852 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01852 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01852 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01852 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01852 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01852 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01852 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01852 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01852 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
P01852 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
P01852 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01852 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01852 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01852 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01852 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01852 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
P01852 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01852 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01852 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01852 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01852 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01852 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01852 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01852 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01852 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01852 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01852 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01852 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01852 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01852 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01852 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01852 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01852 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01852 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01852 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01852 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01852 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01852 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01852 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P01852 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01852 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01852 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01852 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01852 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01852 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01852 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01852 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01852 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01852 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P01852 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01852 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01852 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01852 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
P01852 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01852 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01852 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01852 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01852 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01852 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01852 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01852 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01852 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
P01852 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01852 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01852 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01852 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01852 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01852 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01852 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01852 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01852 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P01852 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P01852 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01852 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01852 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01852 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01852 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01852 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01852 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01852 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01852 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01852 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01852 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01852 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01852 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01852 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01852 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01852 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01852 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms