Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01738 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01738 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01738 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01738 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01738 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01738 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01738 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01738 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01738 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01738 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01738 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01738 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01738 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01738 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01738 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01738 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01738 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01738 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01738 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01738 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01738 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01738 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01738 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01738 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01738 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01738 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01738 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01738 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01738 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01738 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01738 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01738 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01738 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01738 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01738 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01738 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01738 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01738 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01738 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01738 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01738 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01738 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01738 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01738 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01738 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01738 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01738 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01738 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01738 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01738 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01738 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01738 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P01738 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01738 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01738 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01738 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01738 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01738 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01738 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01738 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01738 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01738 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01738 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01738 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01738 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01738 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01738 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01738 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01738 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01738 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01738 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01738 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01738 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01738 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01738 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01738 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01738 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01738 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01738 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01738 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01738 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01738 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01738 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01738 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01738 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01738 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01738 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01738 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01738 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01738 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01738 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01738 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01738 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01738 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01738 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01738 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01738 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01738 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01738 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms