Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01736 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01736 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01736 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01736 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01736 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01736 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01736 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01736 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01736 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01736 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01736 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01736 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01736 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01736 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01736 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01736 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01736 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01736 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01736 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01736 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01736 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01736 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01736 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01736 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01736 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01736 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01736 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P01736 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01736 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01736 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01736 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01736 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01736 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01736 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01736 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01736 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01736 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01736 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01736 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01736 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01736 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01736 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01736 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01736 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01736 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01736 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01736 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01736 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01736 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01736 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01736 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01736 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01736 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01736 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01736 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01736 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01736 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01736 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01736 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01736 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01736 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01736 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01736 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01736 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01736 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01736 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01736 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01736 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01736 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01736 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01736 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01736 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01736 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01736 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01736 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01736 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01736 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01736 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01736 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01736 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01736 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01736 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01736 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01736 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01736 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01736 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01736 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01736 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01736 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01736 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01736 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01736 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01736 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01736 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01736 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01736 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01736 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01736 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01736 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms