Protein–RNA interactions for Protein: O88986

Gcat, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcatO88986 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GcatO88986 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GcatO88986 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GcatO88986 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GcatO88986 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GcatO88986 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GcatO88986 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GcatO88986 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GcatO88986 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GcatO88986 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GcatO88986 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GcatO88986 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GcatO88986 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GcatO88986 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GcatO88986 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GcatO88986 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GcatO88986 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GcatO88986 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GcatO88986 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GcatO88986 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GcatO88986 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GcatO88986 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GcatO88986 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GcatO88986 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GcatO88986 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GcatO88986 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GcatO88986 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GcatO88986 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GcatO88986 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GcatO88986 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GcatO88986 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GcatO88986 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GcatO88986 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GcatO88986 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GcatO88986 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GcatO88986 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GcatO88986 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GcatO88986 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GcatO88986 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GcatO88986 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GcatO88986 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GcatO88986 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GcatO88986 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GcatO88986 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GcatO88986 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GcatO88986 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GcatO88986 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GcatO88986 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GcatO88986 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GcatO88986 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GcatO88986 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GcatO88986 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GcatO88986 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GcatO88986 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GcatO88986 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GcatO88986 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GcatO88986 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GcatO88986 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GcatO88986 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GcatO88986 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GcatO88986 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GcatO88986 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GcatO88986 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GcatO88986 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GcatO88986 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GcatO88986 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GcatO88986 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GcatO88986 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GcatO88986 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GcatO88986 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GcatO88986 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GcatO88986 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GcatO88986 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GcatO88986 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GcatO88986 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GcatO88986 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GcatO88986 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GcatO88986 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GcatO88986 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GcatO88986 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GcatO88986 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GcatO88986 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GcatO88986 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GcatO88986 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GcatO88986 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GcatO88986 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GcatO88986 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GcatO88986 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GcatO88986 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GcatO88986 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GcatO88986 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GcatO88986 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GcatO88986 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GcatO88986 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GcatO88986 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GcatO88986 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GcatO88986 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GcatO88986 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GcatO88986 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GcatO88986 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms