Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F11rO88792 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F11rO88792 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F11rO88792 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F11rO88792 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
F11rO88792 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F11rO88792 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F11rO88792 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F11rO88792 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
F11rO88792 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
F11rO88792 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
F11rO88792 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F11rO88792 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F11rO88792 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F11rO88792 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
F11rO88792 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
F11rO88792 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
F11rO88792 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
F11rO88792 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F11rO88792 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
F11rO88792 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F11rO88792 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F11rO88792 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F11rO88792 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F11rO88792 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F11rO88792 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F11rO88792 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F11rO88792 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F11rO88792 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F11rO88792 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F11rO88792 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F11rO88792 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
F11rO88792 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
F11rO88792 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
F11rO88792 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
F11rO88792 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
F11rO88792 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
F11rO88792 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F11rO88792 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F11rO88792 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F11rO88792 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F11rO88792 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F11rO88792 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F11rO88792 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F11rO88792 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F11rO88792 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
F11rO88792 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
F11rO88792 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
F11rO88792 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
F11rO88792 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
F11rO88792 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
F11rO88792 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F11rO88792 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F11rO88792 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F11rO88792 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
F11rO88792 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
F11rO88792 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
F11rO88792 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
F11rO88792 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
F11rO88792 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
F11rO88792 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
F11rO88792 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
F11rO88792 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
F11rO88792 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
F11rO88792 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
F11rO88792 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F11rO88792 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F11rO88792 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F11rO88792 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
F11rO88792 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
F11rO88792 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
F11rO88792 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F11rO88792 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F11rO88792 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
F11rO88792 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F11rO88792 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F11rO88792 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F11rO88792 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
F11rO88792 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F11rO88792 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
F11rO88792 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F11rO88792 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F11rO88792 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F11rO88792 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
F11rO88792 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F11rO88792 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F11rO88792 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F11rO88792 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F11rO88792 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F11rO88792 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F11rO88792 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F11rO88792 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F11rO88792 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F11rO88792 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F11rO88792 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F11rO88792 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F11rO88792 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F11rO88792 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F11rO88792 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
F11rO88792 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms