Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZfrO88532 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZfrO88532 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZfrO88532 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZfrO88532 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZfrO88532 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZfrO88532 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZfrO88532 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ZfrO88532 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZfrO88532 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZfrO88532 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZfrO88532 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZfrO88532 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZfrO88532 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZfrO88532 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZfrO88532 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZfrO88532 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZfrO88532 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZfrO88532 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZfrO88532 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZfrO88532 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZfrO88532 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZfrO88532 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZfrO88532 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZfrO88532 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZfrO88532 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZfrO88532 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZfrO88532 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZfrO88532 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZfrO88532 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZfrO88532 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZfrO88532 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZfrO88532 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZfrO88532 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZfrO88532 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZfrO88532 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZfrO88532 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZfrO88532 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZfrO88532 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZfrO88532 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZfrO88532 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZfrO88532 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZfrO88532 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZfrO88532 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZfrO88532 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZfrO88532 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZfrO88532 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZfrO88532 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZfrO88532 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZfrO88532 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZfrO88532 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZfrO88532 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZfrO88532 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZfrO88532 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZfrO88532 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZfrO88532 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZfrO88532 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZfrO88532 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms