Protein–RNA interactions for Protein: O88491

Nsd1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd1O88491 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Nsd1O88491 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Nsd1O88491 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Nsd1O88491 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Nsd1O88491 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Nsd1O88491 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Nsd1O88491 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Nsd1O88491 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,91
Nsd1O88491 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Nsd1O88491 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Nsd1O88491 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Nsd1O88491 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Nsd1O88491 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Nsd1O88491 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,71■□□□□ 0,91
Nsd1O88491 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Nsd1O88491 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Nsd1O88491 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Nsd1O88491 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Nsd1O88491 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20,63■□□□□ 0,89
Nsd1O88491 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Nsd1O88491 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Nsd1O88491 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Nsd1O88491 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Nsd1O88491 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Nsd1O88491 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Nsd1O88491 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20,59■□□□□ 0,89
Nsd1O88491 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Nsd1O88491 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20,58■□□□□ 0,89
Nsd1O88491 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Nsd1O88491 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Nsd1O88491 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Nsd1O88491 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Nsd1O88491 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Nsd1O88491 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Nsd1O88491 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Nsd1O88491 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Nsd1O88491 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Nsd1O88491 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,39■□□□□ 0,85
Nsd1O88491 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Nsd1O88491 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Nsd1O88491 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Nsd1O88491 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Nsd1O88491 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Nsd1O88491 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20,34■□□□□ 0,85
Nsd1O88491 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20,34■□□□□ 0,85
Nsd1O88491 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Nsd1O88491 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
Nsd1O88491 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Nsd1O88491 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20,31■□□□□ 0,84
Nsd1O88491 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Nsd1O88491 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Nsd1O88491 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Nsd1O88491 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20,27■□□□□ 0,83
Nsd1O88491 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Nsd1O88491 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Nsd1O88491 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,25■□□□□ 0,83
Nsd1O88491 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20,24■□□□□ 0,83
Nsd1O88491 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Nsd1O88491 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Nsd1O88491 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Nsd1O88491 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Nsd1O88491 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,3 ms