Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AurkcO88445 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AurkcO88445 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AurkcO88445 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AurkcO88445 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AurkcO88445 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AurkcO88445 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AurkcO88445 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AurkcO88445 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AurkcO88445 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AurkcO88445 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AurkcO88445 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AurkcO88445 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AurkcO88445 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AurkcO88445 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AurkcO88445 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AurkcO88445 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AurkcO88445 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AurkcO88445 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AurkcO88445 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AurkcO88445 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AurkcO88445 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AurkcO88445 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AurkcO88445 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AurkcO88445 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AurkcO88445 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AurkcO88445 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AurkcO88445 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AurkcO88445 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AurkcO88445 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AurkcO88445 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AurkcO88445 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AurkcO88445 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AurkcO88445 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AurkcO88445 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AurkcO88445 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AurkcO88445 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AurkcO88445 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AurkcO88445 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AurkcO88445 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AurkcO88445 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AurkcO88445 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AurkcO88445 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AurkcO88445 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AurkcO88445 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AurkcO88445 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AurkcO88445 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AurkcO88445 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AurkcO88445 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AurkcO88445 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AurkcO88445 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AurkcO88445 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AurkcO88445 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AurkcO88445 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AurkcO88445 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AurkcO88445 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AurkcO88445 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AurkcO88445 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AurkcO88445 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AurkcO88445 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AurkcO88445 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AurkcO88445 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AurkcO88445 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AurkcO88445 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AurkcO88445 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AurkcO88445 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AurkcO88445 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AurkcO88445 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AurkcO88445 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AurkcO88445 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AurkcO88445 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms