Protein–RNA interactions for Protein: O70570

Pigr, Polymeric immunoglobulin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigrO70570 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PigrO70570 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PigrO70570 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PigrO70570 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PigrO70570 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PigrO70570 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PigrO70570 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PigrO70570 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PigrO70570 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PigrO70570 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PigrO70570 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PigrO70570 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PigrO70570 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PigrO70570 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PigrO70570 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PigrO70570 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PigrO70570 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PigrO70570 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PigrO70570 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PigrO70570 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PigrO70570 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PigrO70570 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PigrO70570 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PigrO70570 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PigrO70570 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigrO70570 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigrO70570 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PigrO70570 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PigrO70570 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PigrO70570 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PigrO70570 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PigrO70570 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PigrO70570 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigrO70570 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigrO70570 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PigrO70570 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PigrO70570 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PigrO70570 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PigrO70570 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PigrO70570 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PigrO70570 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PigrO70570 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PigrO70570 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PigrO70570 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PigrO70570 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PigrO70570 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PigrO70570 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PigrO70570 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PigrO70570 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PigrO70570 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PigrO70570 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PigrO70570 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PigrO70570 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PigrO70570 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PigrO70570 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PigrO70570 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PigrO70570 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PigrO70570 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PigrO70570 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PigrO70570 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PigrO70570 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PigrO70570 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PigrO70570 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PigrO70570 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PigrO70570 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PigrO70570 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PigrO70570 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PigrO70570 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PigrO70570 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PigrO70570 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PigrO70570 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PigrO70570 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PigrO70570 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PigrO70570 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PigrO70570 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PigrO70570 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PigrO70570 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PigrO70570 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PigrO70570 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PigrO70570 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PigrO70570 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PigrO70570 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PigrO70570 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PigrO70570 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PigrO70570 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PigrO70570 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PigrO70570 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PigrO70570 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PigrO70570 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PigrO70570 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PigrO70570 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PigrO70570 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PigrO70570 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PigrO70570 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PigrO70570 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PigrO70570 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PigrO70570 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PigrO70570 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PigrO70570 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PigrO70570 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms