Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pknox1O70477 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pknox1O70477 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pknox1O70477 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pknox1O70477 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pknox1O70477 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pknox1O70477 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pknox1O70477 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pknox1O70477 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pknox1O70477 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pknox1O70477 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pknox1O70477 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pknox1O70477 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pknox1O70477 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pknox1O70477 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pknox1O70477 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pknox1O70477 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pknox1O70477 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pknox1O70477 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pknox1O70477 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pknox1O70477 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pknox1O70477 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pknox1O70477 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pknox1O70477 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pknox1O70477 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pknox1O70477 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pknox1O70477 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pknox1O70477 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pknox1O70477 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pknox1O70477 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pknox1O70477 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pknox1O70477 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pknox1O70477 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pknox1O70477 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pknox1O70477 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pknox1O70477 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pknox1O70477 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pknox1O70477 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pknox1O70477 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pknox1O70477 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pknox1O70477 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pknox1O70477 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pknox1O70477 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pknox1O70477 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pknox1O70477 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pknox1O70477 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pknox1O70477 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pknox1O70477 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pknox1O70477 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pknox1O70477 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pknox1O70477 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox1O70477 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox1O70477 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox1O70477 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pknox1O70477 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pknox1O70477 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pknox1O70477 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pknox1O70477 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms