Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alx3O70137 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alx3O70137 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx3O70137 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx3O70137 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alx3O70137 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alx3O70137 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alx3O70137 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx3O70137 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alx3O70137 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx3O70137 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alx3O70137 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alx3O70137 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alx3O70137 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alx3O70137 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alx3O70137 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alx3O70137 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alx3O70137 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alx3O70137 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alx3O70137 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alx3O70137 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alx3O70137 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alx3O70137 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alx3O70137 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Alx3O70137 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alx3O70137 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alx3O70137 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alx3O70137 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alx3O70137 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alx3O70137 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx3O70137 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx3O70137 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alx3O70137 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alx3O70137 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms