Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
HcrtO55241 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
HcrtO55241 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
HcrtO55241 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
HcrtO55241 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
HcrtO55241 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
HcrtO55241 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
HcrtO55241 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
HcrtO55241 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
HcrtO55241 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
HcrtO55241 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,49■■□□□ 1,67
HcrtO55241 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
HcrtO55241 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
HcrtO55241 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,42■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,41■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
HcrtO55241 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
HcrtO55241 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
HcrtO55241 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,35■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
HcrtO55241 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
HcrtO55241 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
HcrtO55241 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
HcrtO55241 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
HcrtO55241 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
HcrtO55241 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
HcrtO55241 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,28■■□□□ 1,64
HcrtO55241 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
HcrtO55241 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
HcrtO55241 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
HcrtO55241 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
HcrtO55241 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
HcrtO55241 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
HcrtO55241 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
HcrtO55241 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,23■■□□□ 1,63
HcrtO55241 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
HcrtO55241 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
HcrtO55241 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
HcrtO55241 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
HcrtO55241 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
HcrtO55241 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
HcrtO55241 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
HcrtO55241 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
HcrtO55241 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
HcrtO55241 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
HcrtO55241 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
HcrtO55241 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,14■■□□□ 1,62
HcrtO55241 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
HcrtO55241 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
HcrtO55241 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
HcrtO55241 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
HcrtO55241 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,1■■□□□ 1,61
HcrtO55241 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
HcrtO55241 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
HcrtO55241 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
HcrtO55241 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
HcrtO55241 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,08■■□□□ 1,61
HcrtO55241 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,03■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
HcrtO55241 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
HcrtO55241 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
HcrtO55241 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,01■■□□□ 1,59
HcrtO55241 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
HcrtO55241 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
HcrtO55241 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
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