Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SlkO54988 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SlkO54988 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SlkO54988 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SlkO54988 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SlkO54988 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SlkO54988 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SlkO54988 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SlkO54988 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SlkO54988 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SlkO54988 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SlkO54988 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SlkO54988 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SlkO54988 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SlkO54988 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SlkO54988 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SlkO54988 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SlkO54988 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SlkO54988 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SlkO54988 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SlkO54988 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SlkO54988 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SlkO54988 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SlkO54988 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SlkO54988 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SlkO54988 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SlkO54988 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SlkO54988 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SlkO54988 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SlkO54988 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SlkO54988 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SlkO54988 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SlkO54988 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SlkO54988 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SlkO54988 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SlkO54988 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SlkO54988 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SlkO54988 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SlkO54988 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SlkO54988 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SlkO54988 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SlkO54988 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SlkO54988 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SlkO54988 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SlkO54988 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SlkO54988 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SlkO54988 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SlkO54988 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SlkO54988 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SlkO54988 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SlkO54988 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SlkO54988 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SlkO54988 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SlkO54988 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SlkO54988 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SlkO54988 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SlkO54988 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SlkO54988 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SlkO54988 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SlkO54988 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SlkO54988 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SlkO54988 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SlkO54988 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SlkO54988 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SlkO54988 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SlkO54988 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SlkO54988 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SlkO54988 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SlkO54988 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SlkO54988 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SlkO54988 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SlkO54988 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SlkO54988 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SlkO54988 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SlkO54988 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SlkO54988 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SlkO54988 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SlkO54988 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SlkO54988 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SlkO54988 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SlkO54988 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SlkO54988 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SlkO54988 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SlkO54988 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SlkO54988 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SlkO54988 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SlkO54988 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SlkO54988 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SlkO54988 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SlkO54988 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SlkO54988 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SlkO54988 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SlkO54988 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SlkO54988 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SlkO54988 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SlkO54988 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SlkO54988 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SlkO54988 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SlkO54988 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SlkO54988 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms