Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnk2O54967 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnk2O54967 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnk2O54967 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnk2O54967 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnk2O54967 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnk2O54967 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnk2O54967 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnk2O54967 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnk2O54967 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnk2O54967 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnk2O54967 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnk2O54967 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnk2O54967 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnk2O54967 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnk2O54967 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnk2O54967 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnk2O54967 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnk2O54967 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnk2O54967 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnk2O54967 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnk2O54967 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnk2O54967 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnk2O54967 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnk2O54967 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnk2O54967 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnk2O54967 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnk2O54967 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnk2O54967 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnk2O54967 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnk2O54967 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnk2O54967 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnk2O54967 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnk2O54967 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnk2O54967 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnk2O54967 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnk2O54967 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnk2O54967 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnk2O54967 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnk2O54967 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnk2O54967 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnk2O54967 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnk2O54967 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnk2O54967 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnk2O54967 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnk2O54967 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnk2O54967 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnk2O54967 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnk2O54967 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnk2O54967 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnk2O54967 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnk2O54967 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnk2O54967 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnk2O54967 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnk2O54967 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnk2O54967 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnk2O54967 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnk2O54967 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnk2O54967 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnk2O54967 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnk2O54967 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnk2O54967 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnk2O54967 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnk2O54967 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnk2O54967 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnk2O54967 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnk2O54967 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnk2O54967 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnk2O54967 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnk2O54967 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnk2O54967 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnk2O54967 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnk2O54967 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnk2O54967 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms