Protein–RNA interactions for Protein: O54828

Rgs9, Regulator of G-protein signaling 9, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs9O54828 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rgs9O54828 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rgs9O54828 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Rgs9O54828 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rgs9O54828 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rgs9O54828 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rgs9O54828 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rgs9O54828 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rgs9O54828 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rgs9O54828 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Rgs9O54828 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rgs9O54828 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rgs9O54828 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rgs9O54828 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rgs9O54828 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rgs9O54828 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rgs9O54828 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rgs9O54828 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rgs9O54828 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rgs9O54828 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rgs9O54828 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rgs9O54828 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rgs9O54828 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rgs9O54828 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rgs9O54828 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rgs9O54828 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rgs9O54828 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rgs9O54828 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rgs9O54828 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rgs9O54828 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rgs9O54828 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rgs9O54828 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rgs9O54828 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rgs9O54828 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rgs9O54828 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rgs9O54828 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rgs9O54828 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rgs9O54828 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rgs9O54828 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rgs9O54828 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rgs9O54828 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rgs9O54828 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rgs9O54828 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rgs9O54828 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rgs9O54828 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rgs9O54828 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rgs9O54828 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rgs9O54828 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rgs9O54828 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rgs9O54828 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rgs9O54828 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rgs9O54828 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rgs9O54828 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rgs9O54828 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rgs9O54828 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rgs9O54828 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rgs9O54828 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rgs9O54828 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rgs9O54828 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rgs9O54828 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rgs9O54828 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rgs9O54828 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rgs9O54828 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rgs9O54828 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rgs9O54828 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rgs9O54828 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rgs9O54828 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rgs9O54828 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rgs9O54828 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rgs9O54828 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms